办理投标保函的流程相对严谨，但每一步都至关重要。以下是具体的办理步骤：
1、准备资料：
招标文件资料：包括招标公告、招标文件等。
基础交易合同资料及履约记录：提供公司对同类项目的履约记录，以证明公司的履约能力和信誉。
常规授信资料：如营业执照、法人代码证书、税务登记证、财务报表、公司决议等，这些资料是银行评估申请人资质的重要依据。
保函格式：通常招标文件中会提供要求的保函格式文本，申请人需按照要求填写。
2、填写申请：
申请人需填写《保函申请书》，并附上上述所有准备好的资料。
3、银行审查：
银行将对申请人的申请内容进行审查，包括资质、信用状况、履约能力等。
4、签订协议：
审查通过后，银行与申请人签订协议，明确双方的权利和义务。申请人需按照协议要求提供相应的担保措施。
5、开立保函：
银行根据协议内容，为申请人开立投标保函。保函的有效期一般不超过六个月，从开出之日起生效。
6、提交保函：
申请人将开立好的投标保函随同投标文件一并提交给招标人。
履约保函：
由担保人为施工方(申请人)向业主(受益人)提供的，保证施工方履行工程建设合同责任和义务，承包商不履行合同的，业主可要求保证人在保函金额内承担保证责任。保证人在承担保证责任后，可依法向承包商追偿。履约保函也可以适用于分包合同、材料设备供货合同的履行。
预付款保函和履约保函的区别：
1、担保的期限时间不同
履约保函一般是在签订合同前要求出具。简而言之是为了防止施工单位或供货商不按合同约定履行义务。担保的时间往往要贯穿整个项目，比较长。预付款保函一般是在业主方拨付预付款前要求出具。其实为了防止施工单位或供货商未按照要求合理使用预付款或者未按时开工等情况。担保的时间往往不长，大部分的项目一般为1-3个月，具体以施工合同约定为准。
2、用途不同
预付款保函用于确保预付款的支付，而履约保函用于确保合同履行。
3、失效时间不同
预付款保函在预付款抵扣完毕后失效，而履约保函在合同期履行完毕后失效。
如何处理到期预付款保函？
1、办理的免保证金银行预付款保函则就地销毁即可；
2、交保证金到银行办理的银行保函则需要退回保函原件，这样才能退回保证金。
3、通过担保公司出的保函，如果没有保证金的话，可以直接销毁。